Почему для пенициллин-связывающих белков комплекс фермент-пептид менее стабилен, чем комплекс фермент-β-лактам?

Я пытаюсь понять это. Я не могу найти каких-либо публикаций, подробно описывающих химию ингибирования PBP β-лактамными антибиотиками.

PBP сшивают соседние пентапептиды с образованием пептидогликана. Насколько я понимаю, у большинства бактерий этот пентапептид имеет терминальный дипептид D-Ala-D-Ala. Фермент удаляет концевой D-Ala и образует комплекс D-Ala-фермент, где фермент связан с остальной частью пептида через сложноэфирную связь с D-Ala.

Однако, когда PBP связываются с β-лактамами, они также образуют комплекс β-лактам-эфир-фермент. Однако этот комплекс более стабилен, поэтому β-лактам остается в активном центре. Почему?

Любые хорошие публикации также очень приветствуются.

Я также хотел бы спросить, почему комплекс «β-лактамоил-фермент» не может быть гидролизован?

Ответы (1)

В соответствии с принципом медицинской химии Фойеса , существенным отличием является скопление активного центра циклом рядом с лактамным кольцом, что предотвращает атаку сложного эфира и высвобождение лекарства из PBP.

химия сшивания и связывания бета-лактамов

Обращение реакции на бета-лактам неблагоприятно, учитывая возникающую в результате кольцевую деформацию.

Лично я ожидаю, что сложный эфир будет гидролизоваться (вода намного меньше), но не очень быстро, учитывая, что активный центр несколько защищает комплекс от воды. Фойс с этим не согласен. («Вода также является недостаточно эффективным нуклеофилом и не может гидролизовать комплекс».)

Почему для пенициллин-связывающих белков комплекс фермент-пептид менее стабилен, чем комплекс фермент-β-лактам?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v