При переносе гена с помощью микроинъекции интересующий ген вводят в ядро клетки-хозяина без использования фермента интегразы. Так зачем ВИЧ нужен этот фермент? Почему бы им просто не поместить свою ДНК в ядро и оставить ее там?
During gene transfer by microinjection the DNA has at least some fragments of identical DNA sequence to the host genome. Usually DNA that is used for microinjection will have flanks on either side identical in sequence to two nearly situated, sometimes adjacent blocks of DNA sequence. This allows homologous recombination to occur which engages proteins already present in the host cell: https://en.wikipedia.org/wiki/Homologous_recombination
In case of HIV, there are no fragments of identical sequence flanking the genome of the virus, so no homologous recombination can occur, therefore integrase is necessary. Furthermore, integrase inserts viral genome into random parts of the host genome unlike homologous recombination, which would always localize that viral genome into the same spot each time.
Итак, это мое дикое предположение, поскольку я не смог найти никаких доказательств в литературе, но я бы сказал, что это дает вирусу определенное преимущество. Сайт-специфическая вставка может быть легко ингибирована в ходе эволюции мутациями в геноме хозяина, и в конечном итоге вирус будет устранен. Это не относится к случайному распределению, поскольку никакие мутации в геноме хозяина никогда существенно не изменят вероятность интеграции.
Вот хороший обзор процесса интеграции ДНК в отношении ВИЧ: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3385939/
Дайте мне знать, если это поможет, сопоставьте свое мнение с тем, что я думаю.
Ваше здоровье,
Кшиштоф