Полногеномное секвенирование и В-хромосомы

Обнаруживают ли методы полногеномного секвенирования В-хромосомы, если такие хромосомы присутствуют?

Мое понимание заключается в следующем:

Способ картирования материала ДНК в В-хромосоме зависит от эталонной карты, а не от того, как материал упакован в хромосомы секвенируемого образца.

Это верно?

Ответы (3)

Вы можете использовать различия в покрытии (количество прочтений, сопоставленных с определенными референтными областями), чтобы сделать вывод о наличии В-хромосомы.

Анализ степени охвата прочтений NGS может дать информацию о геномном содержании В-хромосомы. Взгляните на статью, упомянутую ниже:

Валенте Г.Т. и др. (2014). Происхождение и эволюция В-хромосом у цихлид Astatotilapia latifasciata на основе интегрированного геномного анализа. Мол Биол Эвол. 2014 авг; 31 (8): 2061-72

Не могли бы вы добавить небольшое объяснение того, как покрытие можно использовать для определения геномного содержания В-хромосомы. Также подойдет иллюстративная фигура из упомянутой ссылки. Мы были бы очень признательны за некоторые пояснения в дополнение к предоставлению ссылки на ссылку.

введите описание изображения здесь

На прилагаемом рисунке показано покрытие считывания Illumina для двух образцов 0B, двух образцов 1B и одного образца 2B. Обратите внимание, что на рисунке показаны определенные области генома с более высоким охватом прочтений для образцов 1B и 2B по сравнению с образцами 0B.

Добро пожаловать в био. Не могли бы вы указать источники ваших данных и ответить? Ссылки здесь приветствуются.
Полногеномное секвенирование и В-хромосомы
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v