Я имею в виду основные регуляторные механизмы, такие как общие факторы транскрипции , активаторы , репрессоры и РНК-интерференция .
Если бы неактивные гены-регуляторы, использующие каждый из различных механизмов, были активированы, какова была бы задержка (в среднем) между активацией каждого из этих генов и их последующим регулирующим эффектом?
Люди часто неточно говорят, что тип регуляции происходит от нескольких минут до нескольких часов, и это может быть настолько точным, насколько вы можете получить, учитывая изменчивую кинетику любого данного пути.
Кроме того, все гены у эукариот требуют общих факторов транскрипции, но в основном всем им также требуются активаторы, чтобы действовать первыми, чтобы рекрутировать GTF и компоненты, модифицирующие гистоны (что позволяет GTF и их дружественной РНК-полимеразе получать доступ к генам). Таким образом, они обычно находятся ниже активаторов, и их рекрутирование является частью того, что способствует кинетике эуакриот.
Для РНКи кинетика нокдауна в РНКи может в значительной степени зависеть от скорости деградации белка (которая СИЛЬНО варьируется). Даже если вы уберете мРНК, белок останется там, пока не распадется. Если обычно она быстро разлагается, кинетика деградации мРНК будет ограниченной. Если медленно, то придется ждать, пока белок расщепится по его естественным механизмам ( https://en.wikipedia.org/wiki/Proteasome ).
Sigma заявляет, что эффекты РНК-интерференции можно увидеть примерно через 24 часа.
Thermo подразумевает нечто подобное, говоря, что эффекты РНК-интерференции можно наблюдать в течение 5-7 дней после трансфекции (т. е. они подразумевают, что их можно увидеть через день).
Джори
Джори