Существует ли база данных кариотипов для клеточных линий человека?

Насколько я знаю и обнаружил, не существует единой основной базы данных для кариотипов всех линий клеток человека. Они обычно группируются в подмножества либо по какой-то общности (например, рак), либо просто из-за того, кем/где они были разработаны и как они решили разделить линию. Некоторые хорошие базы данных/ресурсы:

1. ATCC — отличный репозиторий, в котором есть таблицы данных, ссылки, изображения и информация о культивировании клеточных линий. Я настоятельно рекомендую использовать ATCC в качестве первой остановки, когда вы хотите узнать больше о линии.
2. Репозиторий генетических клеток человека NIGMS — очень надежный репозиторий, который содержит гораздо больше, чем просто клеточные линии. Это хорошо, но в обилии информации может быть немного сложно просеять.
3. COSMIC — большая коллекция информации о клеточных линиях и обнаруженных в них мутациях. Хорошо, если вы хотите найти/понять определенные генетические аспекты линии.
4. Целлозавр - фантастическая база данных по клеточным линиям! Мне особенно нравится информация о том, что целлозавры содержат разные имена и распространенные орфографические ошибки в названиях клеточных линий. Он также предоставляет информацию об иерархии клеточных линий, то есть когда несколько клеточных линий происходят от родительской линии. Это очень полезно при попытке разобрать литературу с запутанными ссылками на похожие строки. Он также содержит ссылки и перекрестные ссылки. Я не могу рекомендовать это достаточно.

Чтобы вернуться к вашей конкретной клеточной линии, я смог найти только одну ссылку на линию под названием «LG2» — даже с помощью перечисленных выше ресурсов и PubMed , поэтому я, к сожалению, не могу дать вам много информации. на том конкретно. Если в этой строке действительно так мало информации, я бы предложил связаться с источником (коллега, лаборатория, лист Excel, связанный с вашей системой хранения и т. д.), чтобы ваши ячейки увидели, какая информация у них есть. Если вы не можете ничего найти таким образом, может быть лучше просто отправить образец для секвенирования самостоятельно и получить эту информацию там.