Итак, я пытаюсь смоделировать производство 3-гидроксипропионовой кислоты с помощью E.coli через путь пропионил-КоА. Однако я не совсем уверен, как идет производство в пути. У меня получилась следующая картина:
Если я правильно понимаю, то путь идет: Ацетил-КоА--> Пропионат --> Пропионил-КоА --> .... --> 3-ГП При добавлении этих реакций в Кобру всегда ли стехиометрические коэффициенты равны 1?
Если я правильно понимаю, путь идет: Ацетил-КоА --> Пропионат --> Пропионил-КоА --> ... --> 3-ГП.
Не совсем. Первая реакция: Группа КоА переносится из ацетата в пропионат. Следующие реакции представляют собой окисление до акрилоил-КоА и последующую гидратацию до 3-ГП-КоА. Наконец, группу КоА снова переводят в ацетат.
Пропионат представляет собой молекулу из 3 атомов углерода, как и 3-HP. Так что стехиометрические коэффициенты, равные 1, кажутся логичными.