Гетерозиготность и сверхдоминирование

Учитывать м локусы с гетерозиготным преимуществом (сверхдоминированием), так что приспособленность двух гомозигот 1 с 2 а приспособленность гетерозигот 1 + с 2 , где с > 0 . Предположим, что приспособленность индивидуума определяется произведением компонента приспособленности в каждом локусе. Следовательно, приспособленность наилучшего возможного генотипа определяется выражением ( 1 + с 2 ) м .

Согласно этой книге , индивидуум гетерозиготен в Дж из этих м локусы с вероятностью

( м Дж ) ( 1 2 ) м

и равновесная популяция означает пригодность ж ^ является

ж ^ "=" Дж "=" 0 м ( м Дж ) ( 1 2 ) м ( 1 + с 2 ) Дж ( 1 с 2 ) м Дж "=" 1

Я не понимаю ни одного из этих двух уравнений! Можете ли вы помочь мне понять, как они были рассчитаны?


На данный момент мне просто понравилось доказывать, что ж ^ "=" 1 . Мы можем переформулировать ж ^ как

ж ^ "=" ( 1 2 ) м Дж "=" 0 м ( м Дж ) ( 1 + с 2 ) Дж ( 1 с 2 ) м Дж "=" 1

, то используя биномиальное тождество

ж ^ "=" ( 1 2 ) м ( ( 1 + с 2 ) + ( 1 с 2 ) )   м
ж ^ "=" ( 1 2 ) м 2 м
ж ^ "=" 1

Делаю еще одну попытку. Я думаю, что выводы в ссылках проще, и в целом это интересный вопрос.

Ответы (1)

Если приспособленность гетерозиготы ( 1 + с / 2 ) а гомозигота это ( 1 с / 2 ) тогда почему вероятность данного состояния ( 1 + с / 2 ) Дж ( 1 с / 2 ) м к

( м Дж ) ( 1 / 2 ) Дж ( 1 / 2 ) м Дж "=" ( м Дж ) ( 1 / 2 ) м     ?

Как вы указали ранее, в общем случае не обязательно, что п "=" д "=" 1 / 2 но именно это подразумевает приведенная выше форма вероятности. Таким образом, пороговый вопрос заключается в том, почему эта конкретная гетерозиготно-доминантная модель подразумевает равновесные вероятности п "=" д "=" 1 / 2. Я думаю, что идеи ниже начинают решать эту проблему.

Самый простой случай — один локус, два аллеля, и в сети есть много хороших производных. Я думаю, если вы понимаете ситуацию для одного локуса, вы можете обобщить и на более высокие числа. (Надеюсь, я дополню этот ответ, если позволит время. Я думаю, что проще всего было бы предположить п "=" д "=" 1 / 2 и используйте свои фитнес-веса. Это дает нам ж ¯ "=" 1 как знаменатель. Теперь из соображений симметрии, я думаю, вы можете показать, что относительные частоты п и д равны и поэтому п "=" п . Затем вы должны показать, что это равновесное решение единственно.)

Для одного локуса производные «гетерозиготного преимущества», которые я нашел, (1) (2) , присваивают весовые коэффициенты пригодности следующим образом:

АА = (1 - s), Аа = 1, аа = (1 - t)

в котором с , т > 0 , с т вообще, из чего они вытекают как условие равновесия

Δ д "=" п д ( с п т д ) Вт ¯ "=" 0

так

п ^ "=" т с + т       и       д ^ "=" с с + т

в котором п ^ , д ^ - равновесные частоты для каждого аллеля, соответственно, а s и t - скорости мутаций. Нигде я не видел модели, в которой обоим гомозиготным случаям (АА, аа) приписывали одинаковую приспособленность, но это всего лишь частный случай модели преимущества гетерозигот.

пригодность (AA) = пригодность (aa) = (1 - s/2), пригодность (Aa) = (1+ s/2).

Итак, если мы вычтем s/2 из каждой оценки пригодности (или нормализуем по отношению к Aa с тем же эффектом), мы получим:

приспособленность (AA) = приспособленность (aa) = (1-s) и приспособленность (Aa) = 1, как и в двух приведенных выше ссылках, за исключением того, что теперь два гомозиготных состояния имеют одинаковую приспособленность.

Но тогда у нас есть

Δ д "=" п д ( с п с д ) Вт ¯ "=" п д с ( п д ) Вт ¯

и единственное нетривиальное решение п "=" д "=" 1 / 2.

Итак, я предлагаю, что когда вы назначаете одинаковую пригодность обоим А А и а а у вас больше нет общего случая. Что касается принудительного значения s, представляется важным следующее.

Полное выражение из (2) для условия равновесия имеет вид

п "=" п 2 Вт А А + п д Вт А а Вт ¯ ( 1 )

в котором Вт А А "=" Вт а а "=" 1 с и Вт А а "=" 1 и

Вт ¯ "=" п 2 Вт А А + 2 п д Вт А а + д 2 Вт а а

Если гомозиготам приписывается одинаковая приспособленность и п "=" д "=" 1 / 2 , уравнение (1) выше становится:

п "=" 1 4 + 1 4 ( 1 с ) 1 2 + 1 2 ( 1 с )

Программа на странице 583 из (1) полезна. Пусть h:= гетерозигота и m:= гомозигота. Если п "=" д "=" 1 / 2 тогда, пока пригодность (h) и пригодность (m) равны, система немедленно находится в равновесии.

Если п 1 / 2 тогда, пока f(h) = f(m), система достигает равновесия при п "=" 1 / 2 асимптотически. Если п "=" 1 / 2 но ф(ч) f(m) необходимо вычислить асимтотический предел.

См. также http://evol.bio.lmu.de/_teaching/evogen/Evo8-Summary.pdf

Большое спасибо за ваш ответ. Я сейчас в пути, и у меня нет времени читать ваш ответ. Я прочитаю его в среду или четверг, вероятно.
Отличный ответ. В дополнение к вашему (теперь удаленному вами) другому ответу вы прекрасно ответили на мой вопрос. Спасибо. +1
@Remi.b: Спасибо за отзыв. Это был интересный вопрос, и я все еще изучаю эту широкую тему.