Я не понял роли антибиотической среды в фильтрации бактерий, содержащих рекомбинантные плазмиды, с бактериями, имеющими нормальные плазмиды. Поскольку все плазмиды определенного вида бактерий имеют ген устойчивости к антибиотику, независимо от того, рекомбинантный он или нет, не должен ли антибиотик оказывать влияние на колонию?
При выборе селектируемого маркера для плазмиды выбирают ген, который, как известно, отсутствует в интересующем организме-хозяине. Например, стандартные лабораторные штаммы E. coli свободны от внегеномных плазмид и чувствительны к антибиотику ампициллину. Таким образом, плазмиды, придающие устойчивость к ампициллину, обычно используются для поддержания плазмид в лабораторных штаммах E. coli .
То есть бактериальный штамм, имеющий ген, придающий устойчивость к одному антибиотику, все же может быть чувствительным ко многим другим антибиотикам.
Многие встречающиеся в природе плазмиды выбраны для дикой природы, потому что они несут гены, которые позволяют бактериям выполнять новые метаболические функции, или придают гены вирулентности, которые позволяют бактериям заражать организм-хозяин: ( https://en.wikipedia.org/wiki/Plasmid #Свойства_и_характеристики ). Это относится и к рекомбинантным плазмидам. Многие широко используемые дрожжевые плазмиды выбираются для того, чтобы позволить штамму-хозяину продуцировать необходимое питательное вещество, отсутствующее в питательной среде.
Дэйвид