сине-белый скрининг - результаты противоположны ожидаемым

Мы вставили ген GFP в плазмиду Bluescript SK+, трансформировали E. coli этой конструкцией, а затем посеяли на чашку с агаром с ампициллином и X-gal для проведения сине-белого скрининга. Мы получили синие колонии и белые колонии, и обычно белые колонии считаются положительными для вставки, а синие - отрицательными для вставки. Проблема в том, что результаты, которые мы получили, на самом деле противоположны. Если мы посмотрим на планшет под УФ-светом, мы увидим, что ВСЕ синие колонии флуоресцируют, что означает, что они действительно производят GFP, а ВСЕ белые - нет!! Как бы вы это объяснили?? Спасибо

Редактировать: я подумал, что, возможно, вставка может быть в рамке с lacz', поэтому мы получаем слитые белки. Однако это не объясняет, почему мы получили белые колонии, которые не флуоресцируют.

Какие ферменты вы использовали для встраивания? Кроме того, что произойдет, если вы трансформируете исходную неразрезанную плазмиду?
я забыл эту информацию. Мы использовали kpnI для вставки, которая делает надрезы с тупым концом. Мы также посеяли бактерии, трансформированные неразрезанными плазмидами, и получили несколько белых колоний и только одну синюю колонию... но ни одна из них не флуоресцирует.
KpnI не является ферментом тупой рестрикции. Вы уверены, что не перепутали его с другим ферментом? Кроме того, если ваш отрицательный контроль дает белые колонии, то ваши плазмиды, вероятно, дефектны.
О да, простите, kpnI делает сплоченные сокращения
Если бы антибиотик по какой-то причине не работал, вы могли бы получить рост нетрансформированных бактерий.

Ответы (1)

Учитывая тот факт, что неразрезанные плазмиды отрицательного контроля дают белые колонии, кажется, что в гене lacZ в плазмиде произошли значительные мутации, в результате чего неразрезанные плазмиды стали белыми из-за инактивации гена.

Я бы посоветовал приобрести новую партию pBluescript или, если это невозможно по какой-либо причине, выполнить минипрепарат на одной из синих колоний и секвенировать ее сайт множественного клонирования, чтобы убедиться, что MCS присутствует и не мутировал, прежде чем продолжить. Если вы не собираетесь покупать новую партию плазмид, также было бы целесообразно проверить длину плазмиды с помощью гель-электрофореза.

Наиболее вероятное объяснение состоит в том, что плазмиды мутировали, и поэтому вы получаете плохие результаты на синем/белом экране.