Можно ли амплифицировать каждый фрагмент ДНК с помощью ПЦР?

Есть ли способ выполнить неспецифическую ПЦР-амплификацию с целью амплификации каждого присутствующего фрагмента ДНК?

что является источником ДНК? Если незначительные вариации не являются проблемой, вы можете просто измельчить больший объем ткани/культуры, чтобы извлечь больше ДНК. Все клетки вашего тела и большинство клеток в культурах имеют (почти) одинаковую ДНК.
на самом деле, именно так работает RNAseq. Большая часть ДНК производится из РНК, затем к концам фрагментов ДНК добавляются адаптеры (знают короткие последовательности), а затем эти фрагменты ДНК амплифицируются с помощью ПЦР.
Вы спрашиваете об амплификации всего генома ?
А, спасибо, это то, что я искал.

Ответы (2)

Суммируя; Теоретически да.

Практически нет.

Неспецифическая ПЦР требует отжига случайных праймеров с последовательностью-мишенью для инициации репликации во время ПЦР. Теоретически это должно отжигать любую комбинацию оснований и, следовательно, обеспечивать амплификацию всей ДНК (или, по крайней мере, в фрагментированной форме).

Практически все комбинации праймеров будут иметь разные температуры отжига праймеров из-за разного основного состава, что делает амплификацию фрагментации непоследовательной, а в других случаях совершенно невозможной.

Суммируя; Теоретически да.

Практически нет.

Я согласен с этим мнением.

Но есть несколько способов сделать это. Лигирование обоих концов со специфическими метками для амплификации фрагментов ДНК с набором специфичных для метки праймеров. Если у вас фрагменты ДНК разной длины в исходном образце, результаты ПЦР могут быть необъективными.

Можно ли амплифицировать каждый фрагмент ДНК с помощью ПЦР?
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v