Понимание F-статистики в популяционной генетике

Я читаю классическую статью Вейра и Кокерхема 1984 года о Ф С Т предварительный расчет. В начале (первая страница, правая колонка) определяют 3 статистики.

  • Ф корреляция генов внутри особей («инбридинг»)

  • θ это корреляция генов разных особей в одной популяции («совместное происхождение»).

  • ф корреляция генов внутри особей внутри популяций.

Они также заявляют, что 3 статистики связаны

ф знак равно ( Ф θ ) ( 1 θ )

Я не совсем понимаю эти 3 статистики, и особенно я не понимаю, почему это соотношение верно. Вы можете помочь мне с этим?

Я считаю, что бумага 1984 года в некоторых местах немного плотная. Сейчас у меня нет времени объяснять это, но я нашел книгу Брюса Вейра очень поучительной. Вам не нужно читать это прямо. Есть две или три соответствующие главы. Однако для вашего вопроса может быть достаточно хорошего учебника по популяционной генетике, такого как Хартл и Кларк .

Ответы (1)

Я немного колеблюсь в этом вопросе, но я думаю, что самая важная часть информации заключается в том, что они перепараметризируют иерархический анализ вариации Райта (1951), «F-статистику», «иерархическое разделение вариации» или «население». параметры», в зависимости от того, кого вы спросите. Параметры соответствуют следующему (внизу стр.1358): Fit=F, Fis=f, Fst=θ.

Связь возникает при некоторых предположениях. Здесь важно, что если Fis (или f) является мерой отклонения от принципа Харди-Вайнберга, и все популяции одинаково отклоняются от HWP, то Fit = 1 - Hi/Ht. Отсюда следует, что 1 - Fit = Hi/Ht. Кроме того, мы можем переписать это так, что Hi/Ht = (Hi/Hs)(Hs/Ht).

Вместе вы можете (возможно) увидеть, что 1-Fit = (1-Fis)(1-Fst). Подставляя, 1-F = (1-f)(1-θ).

(Я понимаю, что это не полный ответ, но я думаю, вы можете изменить его с помощью некоторой алгебры, чтобы получить уравнение Вейра и Кокерхема).

[Обновление от 25 октября 2016 г.]: в итоге получается f = (F-θ)/(1-θ). Я думаю, что опубликованный вопрос (выше) содержит опечатку, в частности, отсутствующий оператор деления. Возможно, кто-то пропустил штрих на машинке в исходной статье?

Спасибо за ответ. Решение 1 Ф ( 1 ф ) ( 1 θ ) за ф дает ф знак равно θ Ф θ 1 .