Равновесие Харди-Вайнберга, обобщенное для добавления инбридинга (неслучайное спаривание)

Фон

Цитата из книги Гиллеспи

Уровень инбридинга измеряется коэффициентом инбридинга, Ф я , то есть вероятность того, что два аллеля у человека идентичны по происхождению.

Два возможных аллеля А 1 и А 2 и их частоты п и д "=" 1 − п , соответственно. Гиллеспи продолжает и дает ожидаемые частоты генотипов с учетом п (и д ) и Ф я

г е н о т у п е А 1 А 1 А 1 А 2 А 2 А 2 Ф р е д ты е н с у п 2 ( 1 − Ф я ) + п Ф я 2 п д ( 1 − Ф я ) д 2 ( 1 − Ф я ) + д Ф я

Вопрос

Не могли бы вы помочь мне понять, почему это правильные частоты генотипов?

Пример того, что мне непонятно

По определению Ф я , я ожидал, что частота ` А 1 А 2 (и А 2 А 1 ) было бы ( 1 − Ф я ) , то есть частота (или вероятность) того, что два аллеля у человека не идентичны по происхождению. Я чувствую, что определение, данное выше, неверно. Должен ли он быть чем-то вроде веса для выборки, например, отдельных лиц? То есть, если бы было только два возможных партнера, один из которых А 1 А 1 и тот, который либо А 1 А 2 или А 2 А 2 , то вероятность А 1 А 1 индивидуум для спаривания с другим А 1 А 1 является Ф я .

Ответы (1)

Вы запутались, потому что не можете различить «идентичный» и «идентичный по происхождению». Некоторые пары аллелей остались бы идентичными даже в отсутствие инбридинга.

Мы моделируем инбридинг, классифицируя пары аллелей как IDB — всегда гомозиготные — или не IDB — распределенные согласно Харди Вайнбергу. Таким образом , частота пары аллелей A 1 , A 2 (или A 2 , A 1 ) равна частоте при HWE (2pq), умноженной на вероятность того, что они НЕ являются ВЗК (1-FI ) . И наоборот, пара может быть гомозиготной и не ВЗК - на частоте р 2 (1-Ф I ), или потому что они ВЗК - на частоте р Ф I .

+1 О.. хорошо! Меня это немного беспокоит. Концепция ВЗК зависит от произвольного времени в прошлом, за пределами которого, если происходит слияние, мы по-прежнему называем два аллеля СРК (идентичные по состоянию), а не ВЗК (я мог бы процитировать Хартла и Кларка , я думаю, но у меня нет книги сегодня со мной). Я прав?
Да, но эти модели всего лишь простые приближения. Такие понятия, как время и слияние, даже не существуют в идеальном биномиальном мире Харди Вайнберга :)
Хорошо. Я не чувствую себя на 100% ясным с определениями ВЗК и СРК, поэтому я просто открыл «Идентификация по происхождению против идентичности по состоянию» . Спасибо за вашу помощь
Равновесие Харди-Вайнберга, обобщенное для добавления инбридинга (неслучайное спаривание)
СпросиСетьПолитика конфиденциальности1y, 0v