Разбираемся в сравнении ферментов Km

Я сталкивался со сравнениями константы Михаэлиса-Ментен ( К м ) несколько раз. Вообще говоря, если К м фермента выше, то его сродство к своему субстрату ниже. Как это понять?

Может максимальная скорость( В м а Икс ) высшего К м ферменты выше? Тогда, конечно, К м может иметь более высокое значение. Так как К м - концентрация субстрата на половине В м а Икс . Но я думаю, что мы не можем определить сходство с К м .

Ответы (1)

Поскольку константа Михаэлиса-Ментона Km представляет собой концентрацию субстрата при 0,5Vmax, она является обратной мерой его сродства к субстрату, поскольку более низкое значение Km указывает на то, что для достижения определенной скорости реакции требуется меньшее количество субстрата. Следовательно, низкий Km означает высокое сродство к субстрату.

Ваше заявление

«Может быть, максимальная скорость (Vmax) ферментов с более высоким Km выше? Тогда, конечно, Km может иметь более высокое значение».

это неверно. Km характеризует, насколько крутая скорость реакции увеличивается с доступностью субстрата ; он не определяет максимальную скорость.

Наконец, чтобы ответить на ваш вопрос в заголовке, сравнение сродства может иметь большой смысл . Например, рассмотрим случай, когда сравниваются ферменты, катализирующие сходные реакции у разных видов организмов. Очень низкое значение Km означает оптимальное использование малых уровней субстрата, а высокое значение Vmax указывает на оптимальную скорость реакции. Это, в свою очередь, может рассказать вам кое-что об оптимальных средах обитания и эволюционном давлении.

Я мобильный, ссылка будет добавлена ​​позже: ucl.ac.uk/~ucbcdab/enzass/substrate.htm
Чтобы быть конкретным, вот что говорит мой профессор: «Глюкокиназа имеет гораздо более высокое значение (Km) для глюкозы, чем гексокиназа-1. Значение Km глюкокиназы составляет 10 (микромолярное), тогда как значение (Km) для гексокиназы-1 равно 0. ,1 (микромолярный). Следовательно, сродство глюкокиназы к глюкозе низкое.». Теперь предположим, что скорость глюкокиназы в 100 раз выше, чем у гексокиназы, тогда сродство этих двух становится примерно одинаковым. Потому что при концентрации гексокиназы Km они производят почти одинаковое количество продукта. (Я знаю, что на самом деле это не так, потому что графика нелинейная, но... могу я объяснить?)
Сродство к субстрату напоминает желание реакции, что означает выход продукта? Почему тогда мы должны забыть о V и скорости?
Нет, родство отражает привязанность . Km измеряется с использованием Vmax, но абсолютное значение Vmax совершенно не имеет значения для Km. Он просто отражает 0,5vmax, независимо от абсолютного значения Vmax. Вы связываете Km и Vmax, тогда как на самом деле Km ничего не говорит о скорости или продукте. Это что-то говорит о субстрате. Период.