Трансмембранный белок: всегда ли сигнальный пептид образует петлю?

Так что я читал несколько раз, что

б. SP скорее всего образует петлю, а не стрелку. Петля входит в канал (транслокон) в мембране. Петля SP, вероятно, открывает (ворота) канал на цитоплазматической стороне.

Источник

И мне было интересно, почему это так? Мне кажется гораздо более сложным, чтобы белок зацикливался, чем для того, чтобы сигнальный пептид просто внедрялся в пору транслокатора, а остальная часть полипептидной цепи синтезировалась на цитоплазматической стороне.

Затем, если белок должен был снова пройти через мембрану, должна была быть еще одна сигнальная последовательность начала переноса (так что две первые сигнальные последовательности были бы двумя последовательностями начала переноса, а не началом переноса и остановкой переноса).

Ответы (1)

Я думаю, что, возможно, изображение может помочь, также посмотрите здесь некоторые конспекты лекций , откуда я взял изображения: короче говоря, если у вас есть неразорванная цепь, вы не можете просунуть ее через отверстие, кроме как в петлю, если вы не начнете с конца. очень конец, и часто вы не хотите этого делать.

Сигнальные последовательности могут находиться где угодно на белке. Эта часть представляет собой часть пептида, которая связывается с транслокаторной порой в мембране. Эта часть должна оставаться связанной, чтобы процесс продолжался: невозможно просто «прокормить» растущий полипептид, не закрепив его каким-либо образом, и именно это делает сигнальная последовательность, взаимодействуя с транслоконом.

Синтез мембранного белка http://web.uconn.edu/mcb380/fig12-45a.GIF http://web.uconn.edu/mcb380/fig12-45b.GIFСинтез мембранного белка 2

Этот процесс также допускает все виды компоновок: прохождение всего белка или только N- или C-конца, или наличие нескольких сигнальных последовательностей для создания нескольких трансмембранных доменов. Особенно в последнем случае, на самом деле нет никакого другого способа сделать это, кроме как сформировать где-нибудь петлю, если только вы не собираетесь на самом деле лигировать отдельные полипептиды вместе, что было бы довольно грязно и сложно и потребовало бы дополнительных специализированных ферментов: гораздо сложнее чем красивая, аккуратная петля.