каково самое большое известное функциональное расстояние между энхансером и его геном-мишенью (TSS) в цис-положении?

поскольку название кажется самоочевидным; Было бы неплохо, если бы кто-нибудь мог дать ссылку. Я ищу документ, который, как мне кажется, составляет около 1,5 Мб, но все, что выше, будет сердечно приветствоваться. большое спасибо

Ответы (1)

Я нашел не 1,5 Мб, а 1 Мегабазу. Так обстоит дело с геном shh у цыплят, где энхансерный элемент расположен на 1 Мб выше по течению. Оригинал статьи можно найти здесь:

Есть два обзора, которые также интересны в этом контексте:

Спасибо. Я также сталкивался с 1 Мб и расстояниями немного выше, но меня особенно интересует самое длинное известное функциональное расстояние в цис. это не так просто, как я думал, так как я провел несколько часов на ncbi/pubmed ...
Могу еще посмотреть сегодня позже. Вы хоть представляете, для какого организма или для какого гена это было описано?
К сожалению, я не знаю. я могу поверить, что это было в мм, но опять же, если бы я правильно помнил, я бы уже нашел его. все равно еще раз спасибо
в этой статье «Обширные взаимодействия хроматина, ориентированные на промотор, обеспечивают топологическую основу для регуляции транскрипции», по крайней мере, говорится о нахождении расстояний взаимодействия в диапазоне мегабаз ... и останавливается на этом.
Я наткнулся на несколько таких утверждений, но они никогда не отображают данные и не содержат ссылок на них.
Я обнаружил, что «на далеко-далекой хромосоме» и «обширные взаимодействия хроматина с центром в промоторе обеспечивают топологическую основу для регуляции транскрипции». в одной из статей заявлено несколько Мбит/с, а в другой заявлен диапазон 2-3 Мбит/с. они предоставили свои «не полностью необработанные» данные, но я еще не рассчитал сам. во всяком случае, поскольку я думаю, что именно вы рекомендовали хотя бы одну из этих двух статей на другом форуме (каковы шансы), я благодарю вас