Сколько времени требуется для образования пептидной связи?

Сколько времени требуется для образования пептидной связи in vivo или in vitro ? В моем курсе по белковым структурам это не упоминается. Мне просто было любопытно узнать, известна ли какая-либо временная шкала?

Учитывая, что прокариотические и эукариотические клетки имеют разную структуру рибосом, есть ли шанс, что время может различаться между видами или даже внутри видов?

Вас интересует скорость рибосомального включения аминокислот в растущий полипептид?
Канадец: Да. можем ли мы без всякого сомнения сказать, что «время, необходимое для связывания любых 2 аминокислот, всегда равно» ???
@smileandbegin Я полагаю, что это сильно зависит от концентрации аминокислот, связанных с тРНК, в цитозоле. Я не уверен, какова связь между аминокислотами, связанными с тРНК, и аминокислотами, не связанными с кровью/цитозолем, но опять же, я полагаю, что они в какой-то степени пропорциональны. Это означает, что время образования связи между любыми двумя аминокислотами будет варьироваться в зависимости от диеты, метаболизма и, возможно, типа клеток.

Ответы (1)

Alberts et al., Molecular Biology of the Cell , говорят, что эукариотические рибосомы добавляют около 2 аминокислот в секунду, а бактериальные — около 20 в секунду (5-е издание, стр. 275). Их следует принимать только в качестве приблизительных оценок: скорость, безусловно, будет варьироваться от вида к виду, от клетки к клетке, от белка к белку. Некоторые клетки (например, ретикулоциты) являются профессиональными синтезаторами белка. Другие, например бактериальные эндоспоры, почти не синтезируют белок.

Эти авторы оценивают скорость трансляции в эмбриональных стволовых клетках мыши примерно в 5,5 аминокислот в секунду. Существует множество вариаций от гена к гену, даже в пределах одного типа клеток. Они даже видят систематические вариации в зависимости от того, где вы находитесь в гене.