У меня есть два белка, и я буду готовить вектор с обоими генами для стабильной трансфекции. У каждого белка будет свой промотор, и я буду использовать вектор piggyBac для вставки в хромосомы одной кассеты с обоими генами. Мои вопросы:
Я не хочу использовать IRES или 2A-пептид. Я хотел бы иметь возможность контролировать этот эксперимент на стадии транскрипции.
Вы можете использовать двунаправленный промоутер. Проблема, которую вы упомянули о белках, экспрессируемых не на одном уровне, возникает из-за конкуренции за полимеразу. Но есть хорошо оптимизированные части, а также коммерчески доступные векторы, которые отлично работают.
Вы можете клонировать гены в последовательном порядке. Это не будет проблемой. Просто оставьте линкер длиной 100 п.н. после полиА-сигнала предыдущего гена. Если ваша кассета станет слишком большой, вставить ее будет немного сложнее. Вот почему люди используют IRES или TA-пептиды и т. д.
Вставки на основе ретровирусов работают довольно прилично, но вы не можете контролировать изменение числа копий между разными клетками.
Вы можете использовать два разных промоутера. Динамика будет зависеть от силы промотора и концентрации индуктора.
Я просматривал свои вопросы и понял, что это все еще без ответа. Что ж, теперь у меня есть ответ.
Я разработал конструкцию с двумя отдельными промоторами (CMV для одного и Tet-индуцируемым для другого) и получил действительно хорошие результаты. У меня не было никаких трудностей с экспрессией белков. Я смог очень хорошо контролировать Tet-индуцируемый белок и получил стабильные уровни другого белка с CMV.
Короче говоря, вы можете безопасно поместить два гена под два разных промотора, получить с ними стабильные клеточные линии и получить хорошие уровни экспрессии.
Энгин Япичи